More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2574 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  73.64 
 
 		 588 aa  924    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  58.81 
 
 		 595 aa  687    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  60 
 
 		 586 aa  725    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  61.62 
 
 		 595 aa  661    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  61.01 
 
 		 581 aa  738    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  73.81 
 
 		 588 aa  917    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  58.64 
 
 		 593 aa  685    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 		 588 aa  1203    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  58.5 
 
 		 586 aa  691    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  56.52 
 
 		 596 aa  665    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  50.99 
 
 		 586 aa  557  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  49.54 
 
 		 577 aa  542  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  50.26 
 
 		 648 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  58.9 
 
 		 437 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  50.09 
 
 		 624 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  50.09 
 
 		 624 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  49.91 
 
 		 624 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  49.31 
 
 		 625 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  49.04 
 
 		 626 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  47.4 
 
 		 580 aa  511  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  48.52 
 
 		 626 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  47.32 
 
 		 625 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  47.5 
 
 		 624 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  46.29 
 
 		 653 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  46.6 
 
 		 598 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  44.98 
 
 		 596 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  45.08 
 
 		 596 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  46.24 
 
 		 610 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  45.38 
 
 		 596 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  44.44 
 
 		 599 aa  458  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  46.18 
 
 		 623 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  46.18 
 
 		 623 aa  458  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  47.84 
 
 		 571 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  46.36 
 
 		 692 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  46.36 
 
 		 626 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  46.36 
 
 		 627 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  46 
 
 		 627 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  46 
 
 		 627 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  46 
 
 		 627 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  44.34 
 
 		 575 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  46 
 
 		 627 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  45.5 
 
 		 623 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  47.17 
 
 		 628 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  44.65 
 
 		 618 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  44.99 
 
 		 588 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  44.69 
 
 		 583 aa  428  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  42.88 
 
 		 619 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  41.49 
 
 		 669 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  44.52 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  44.22 
 
 		 621 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  41.09 
 
 		 662 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  43.04 
 
 		 572 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  41.89 
 
 		 582 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  40.41 
 
 		 634 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  40.41 
 
 		 634 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  40.41 
 
 		 634 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  40.03 
 
 		 643 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  38.79 
 
 		 658 aa  392  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  40.54 
 
 		 652 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  42.4 
 
 		 648 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  40.5 
 
 		 691 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  40.76 
 
 		 662 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  40.92 
 
 		 662 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  38.34 
 
 		 576 aa  372  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  40.17 
 
 		 660 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  40.26 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  40.1 
 
 		 696 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  38.84 
 
 		 616 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  40.1 
 
 		 661 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  40.1 
 
 		 661 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  37 
 
 		 645 aa  339  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  37.46 
 
 		 578 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  37.21 
 
 		 617 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  36.81 
 
 		 645 aa  336  5.999999999999999e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  39.44 
 
 		 579 aa  333  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 		 581 aa  327  5e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  39.63 
 
 		 590 aa  327  5e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  36.82 
 
 		 589 aa  326  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  34.97 
 
 		 576 aa  320  5e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  36.98 
 
 		 586 aa  320  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  35.8 
 
 		 580 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  34.12 
 
 		 599 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  35.48 
 
 		 579 aa  317  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  36.51 
 
 		 583 aa  317  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2446  gamma-glutamyltransferase  38.27 
 
 		 624 aa  316  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605656  normal  0.196083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  36.33 
 
 		 606 aa  314  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  36.3 
 
 		 612 aa  314  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  35.46 
 
 		 580 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  38.31 
 
 		 614 aa  313  7.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  35.62 
 
 		 580 aa  313  7.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  35.46 
 
 		 580 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  37.59 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  35.52 
 
 		 577 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  37.43 
 
 		 586 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  35.46 
 
 		 580 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  39.07 
 
 		 620 aa  310  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  35.29 
 
 		 580 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 		 581 aa  310  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  36 
 
 		 580 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  36 
 
 		 580 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>