More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1060 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1060  peptidase M23B  100 
 
 		 321 aa  665    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  29.84 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  24.64 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  26.32 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  25.3 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  26.49 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  40.35 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  28.52 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  23.49 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  26.32 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  36.72 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  28.26 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  24.72 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  35.33 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  34.23 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  27.63 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  27.63 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  27.63 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  27.63 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  34.62 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.36 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  23.69 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  23.69 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  33.57 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  23.14 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.43 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  25.94 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  25.32 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  31.25 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  27.66 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  38.1 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  28.28 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  32.28 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  27.83 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  26.75 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  26.75 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  26.75 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  26.75 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  37.98 
 
 		 442 aa  72.4  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  31.03 
 
 		 445 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  26.34 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  36.54 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  34.93 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  34.78 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  32.77 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  32.77 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  27.54 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  32.37 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  31.65 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  25 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  25.44 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  34.4 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  31.93 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  34.27 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  33.04 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  28.81 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  31.67 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  25.95 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  32.26 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  31.5 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  31.76 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  27.87 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  33.59 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  33.33 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  31.71 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  37.62 
 
 		 486 aa  67  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  30.89 
 
 		 394 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  26.29 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  37.62 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  30.95 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  23.75 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  36.15 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  37.62 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  37.62 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  37.62 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  37.62 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  37.62 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  34.65 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  37.62 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  37.62 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  37.62 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  28.97 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  26.32 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  39.08 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  26.5 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  27.64 
 
 		 411 aa  65.9  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  38.04 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  33.67 
 
 		 602 aa  65.9  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  38.71 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  40 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  37.62 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  35.56 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  30.89 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  33.33 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  31.03 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  31.67 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  36.63 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  30.83 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  33.33 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  36.63 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>