More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1538 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1538  Nitrogenase  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  59.76 
 
 		 251 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  55.87 
 
 		 248 aa  281  7.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  51.82 
 
 		 324 aa  270  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0408  nitrogenase  54.25 
 
 		 254 aa  268  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  50.99 
 
 		 280 aa  254  8e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  49.59 
 
 		 290 aa  254  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  49.62 
 
 		 272 aa  251  7e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  51.81 
 
 		 288 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  52.19 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  51.43 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  51.19 
 
 		 268 aa  248  6e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  48.77 
 
 		 276 aa  248  6e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  48.63 
 
 		 276 aa  248  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  51.59 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  49.59 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  51.42 
 
 		 275 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  50 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  51.01 
 
 		 288 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  47.66 
 
 		 292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  51.44 
 
 		 292 aa  244  9e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  50.4 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  48.83 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  50.61 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  50.41 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  50.2 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  51.01 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  50.81 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  51.01 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  51 
 
 		 289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.19 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  48.41 
 
 		 289 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  50.6 
 
 		 288 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  49.19 
 
 		 274 aa  241  7.999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  47.31 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  49.22 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  48.22 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  49.22 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  49.41 
 
 		 300 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  48.95 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  50.4 
 
 		 291 aa  239  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  54.07 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  51.22 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  50 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  48.78 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  50 
 
 		 293 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  52.14 
 
 		 273 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  50.2 
 
 		 289 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  49.59 
 
 		 274 aa  238  6.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  49.6 
 
 		 293 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  48.13 
 
 		 290 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  49.01 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  49.01 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  49.38 
 
 		 276 aa  237  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  49.59 
 
 		 274 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  49.01 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  47.83 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  50.62 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  48.78 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  49.8 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  48.78 
 
 		 299 aa  236  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1430  nitrogenase reductase  48.22 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  47.62 
 
 		 289 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  48.22 
 
 		 298 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  47.08 
 
 		 296 aa  234  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  48.4 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  48.78 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.64 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  47.43 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  47.27 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  48.22 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  48.37 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  45.74 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  44.78 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  47.83 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  47.83 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  48.78 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  47.43 
 
 		 298 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  47.04 
 
 		 295 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  47.04 
 
 		 295 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.22 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6225  nitrogenase reductase  47.04 
 
 		 297 aa  231  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  44.44 
 
 		 292 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  48 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  48.25 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  47.06 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  47.04 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  46.91 
 
 		 731 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7808  nitrogenase reductase  48.37 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7753  nitrogenase reductase  48.37 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  44.03 
 
 		 313 aa  229  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  47.22 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  46.3 
 
 		 324 aa  228  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  44.03 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  47.43 
 
 		 275 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0347  nitrogenase iron protein subunit NifH  47.79 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  47.43 
 
 		 295 aa  228  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  45.91 
 
 		 326 aa  227  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2345  nitrogenase reductase  47.04 
 
 		 296 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.383855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4136  nitrogenase iron protein subunit NifH  46.9 
 
 		 296 aa  226  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0109879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>