260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0408 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0408  nitrogenase  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  58.23 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  55.6 
 
 		 248 aa  271  9e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1538  Nitrogenase  54.25 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  52.03 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  50.81 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  51.39 
 
 		 270 aa  251  7e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  51.63 
 
 		 273 aa  250  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  52.99 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  49.8 
 
 		 280 aa  242  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  50 
 
 		 731 aa  241  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  53.45 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  52.81 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  50 
 
 		 274 aa  238  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  48.59 
 
 		 274 aa  238  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  49.8 
 
 		 273 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  53.25 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  50 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  51.01 
 
 		 276 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.2 
 
 		 287 aa  234  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  45.34 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  49.39 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  50.2 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  51.74 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  48.19 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  48.58 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  48.98 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  51.5 
 
 		 289 aa  231  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  51.93 
 
 		 277 aa  232  6e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  52.38 
 
 		 274 aa  231  7.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  47.2 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  51.95 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  51.72 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.8 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  51.95 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  48.78 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  48.78 
 
 		 274 aa  228  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  46.46 
 
 		 299 aa  228  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  47.2 
 
 		 295 aa  226  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.4 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  46.4 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  46.8 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  47.54 
 
 		 276 aa  225  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  46.46 
 
 		 296 aa  225  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.36 
 
 		 296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  46.46 
 
 		 326 aa  225  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  46.4 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  45.97 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  46.8 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  46.4 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  47.2 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  49.36 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  46.06 
 
 		 324 aa  222  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  46.4 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  45.42 
 
 		 290 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  47.37 
 
 		 299 aa  221  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  46 
 
 		 288 aa  221  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  46 
 
 		 289 aa  221  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  45.6 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  47.2 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.47 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  46.15 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  45.75 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  46.61 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  46.61 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  44.91 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  45.91 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  46.8 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  46 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  48.5 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  47.64 
 
 		 292 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  46.59 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  46 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  44.91 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  46.78 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  47.21 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  46.18 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  43.25 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  44.72 
 
 		 291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  43.25 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  46.59 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  45.38 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1430  nitrogenase reductase  44.44 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  44.49 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4136  nitrogenase iron protein subunit NifH  45.82 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0109879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  43.73 
 
 		 290 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1813  nitrogenase iron protein  46.06 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1785  nitrogenase iron protein  46.06 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  44.15 
 
 		 313 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  44.05 
 
 		 295 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  43.25 
 
 		 293 aa  211  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  44.05 
 
 		 295 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0347  nitrogenase iron protein subunit NifH  42.74 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  43.72 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  44.13 
 
 		 728 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3632  nitrogenase reductase  43.65 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2345  nitrogenase reductase  44.84 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.383855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  43.72 
 
 		 289 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1178  nitrogenase  44.31 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  47.41 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>