More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0774 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  100 
 
 		 290 aa  584  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  80 
 
 		 290 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  62.5 
 
 		 291 aa  362  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  58.51 
 
 		 292 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  60.92 
 
 		 289 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  61.23 
 
 		 324 aa  352  5e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  60.99 
 
 		 289 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  60.87 
 
 		 299 aa  341  8e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3889  nitrogenase  49.47 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  48.24 
 
 		 290 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  52.4 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  50.37 
 
 		 274 aa  279  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  50.18 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  49.26 
 
 		 276 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  50 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  50.55 
 
 		 284 aa  271  9e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  50.19 
 
 		 274 aa  270  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  48.89 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  49.81 
 
 		 272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  50.93 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  49.81 
 
 		 275 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  49.08 
 
 		 278 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  45.86 
 
 		 276 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  52.34 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  45.77 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  51.95 
 
 		 274 aa  266  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  46.48 
 
 		 292 aa  265  7e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  50.19 
 
 		 276 aa  265  8e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  51.17 
 
 		 274 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  49.08 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  49.08 
 
 		 272 aa  263  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  52.34 
 
 		 274 aa  262  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  45.77 
 
 		 292 aa  262  4e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  46.13 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  48.71 
 
 		 280 aa  260  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  51.95 
 
 		 274 aa  260  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  51.95 
 
 		 274 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  47.35 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  48.71 
 
 		 280 aa  258  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  51.56 
 
 		 274 aa  258  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  50.58 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  49.26 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  47.99 
 
 		 270 aa  255  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  47.29 
 
 		 326 aa  254  8e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  47.29 
 
 		 295 aa  254  9e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  47.6 
 
 		 275 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  47.46 
 
 		 296 aa  252  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  47.97 
 
 		 275 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  47.23 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  53.28 
 
 		 251 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  46.86 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  50.19 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  46.49 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  45.16 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  47.31 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  46.86 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  46.49 
 
 		 288 aa  249  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  47.6 
 
 		 275 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  47.37 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  49.42 
 
 		 297 aa  246  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  47.23 
 
 		 275 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  50.62 
 
 		 248 aa  247  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  45.82 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  46.57 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  48.66 
 
 		 299 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  46.13 
 
 		 275 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  50.75 
 
 		 272 aa  246  4e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  46.95 
 
 		 290 aa  245  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  49.03 
 
 		 288 aa  245  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  45.88 
 
 		 303 aa  245  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  45.02 
 
 		 275 aa  244  9e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  45.88 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1538  Nitrogenase  49.59 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925068  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1785  nitrogenase iron protein  45.88 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1813  nitrogenase iron protein  45.88 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  45.02 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  45.02 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  45.02 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  47.86 
 
 		 289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  47.86 
 
 		 289 aa  241  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  45.52 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  45.76 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  47.86 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  45.76 
 
 		 287 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  45.65 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  45.98 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  45.88 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  45.39 
 
 		 289 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  46.01 
 
 		 299 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  46.01 
 
 		 299 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  44.57 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  46.69 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  48.28 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  45.65 
 
 		 298 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  46.21 
 
 		 299 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  46.69 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  46.01 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  43.54 
 
 		 275 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  45.29 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  45.09 
 
 		 293 aa  234  9e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>