More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0795 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  100 
 
 
291 aa  598  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  83.45 
 
 
289 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  84.04 
 
 
289 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  76.16 
 
 
292 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  67.99 
 
 
324 aa  408  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  63.6 
 
 
299 aa  378  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  64.13 
 
 
290 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  62.5 
 
 
290 aa  362  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  50 
 
 
276 aa  294  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  47.99 
 
 
290 aa  290  2e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  52.92 
 
 
284 aa  288  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  49.09 
 
 
292 aa  278  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  49.26 
 
 
273 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  48.73 
 
 
292 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  49.09 
 
 
313 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  51.11 
 
 
273 aa  275  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  48.51 
 
 
292 aa  275  7e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  49.28 
 
 
283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  47.78 
 
 
273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  53.44 
 
 
274 aa  273  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  52.29 
 
 
276 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  50.18 
 
 
292 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  49.08 
 
 
270 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.36 
 
 
296 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  49.45 
 
 
272 aa  270  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  48.52 
 
 
299 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  51.29 
 
 
277 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  53.31 
 
 
288 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  51.33 
 
 
288 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  47.69 
 
 
280 aa  269  2.9999999999999997e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  49.81 
 
 
295 aa  269  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  50.38 
 
 
275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  50 
 
 
268 aa  268  8e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  47.33 
 
 
290 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.89 
 
 
296 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.43 
 
 
287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  48.89 
 
 
288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  50.74 
 
 
276 aa  265  5e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  50.38 
 
 
272 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  53.12 
 
 
274 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  51.91 
 
 
274 aa  265  8.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  48.72 
 
 
272 aa  264  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  48.85 
 
 
278 aa  264  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  49.43 
 
 
296 aa  264  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  52.34 
 
 
274 aa  264  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  51.33 
 
 
296 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  52.73 
 
 
274 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  52.73 
 
 
274 aa  263  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  52.73 
 
 
274 aa  264  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  52.14 
 
 
289 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  52.53 
 
 
289 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3889  nitrogenase  45.45 
 
 
288 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  48.15 
 
 
291 aa  263  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  48.15 
 
 
275 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  51.75 
 
 
288 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  47.97 
 
 
280 aa  262  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  52.34 
 
 
274 aa  263  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.81 
 
 
324 aa  262  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  48.3 
 
 
289 aa  262  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  49.23 
 
 
299 aa  261  6.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  50.19 
 
 
298 aa  261  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  48.5 
 
 
326 aa  261  8.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  47.78 
 
 
275 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  50.58 
 
 
288 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  46.86 
 
 
275 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  51.36 
 
 
289 aa  260  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  49.23 
 
 
297 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  49.81 
 
 
293 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  50 
 
 
276 aa  259  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  46.49 
 
 
275 aa  258  6e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  50.58 
 
 
290 aa  258  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1813  nitrogenase iron protein  47.78 
 
 
296 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  50.97 
 
 
289 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1785  nitrogenase iron protein  47.78 
 
 
296 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  50.38 
 
 
276 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  50.58 
 
 
289 aa  257  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  47.78 
 
 
298 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  49.62 
 
 
299 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  49.62 
 
 
300 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  49.62 
 
 
299 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  46.67 
 
 
275 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  51.56 
 
 
274 aa  256  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  48.31 
 
 
298 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  46.13 
 
 
275 aa  255  7e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  48.15 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0347  nitrogenase iron protein subunit NifH  46.47 
 
 
265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  48.31 
 
 
299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  47.94 
 
 
299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  45.76 
 
 
275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  47.96 
 
 
295 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  44.53 
 
 
264 aa  252  6e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  45.93 
 
 
275 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  46.84 
 
 
303 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6225  nitrogenase reductase  48.31 
 
 
297 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  46.84 
 
 
293 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  47.21 
 
 
295 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  47.55 
 
 
275 aa  250  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  47.21 
 
 
295 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  46.99 
 
 
290 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  47.96 
 
 
293 aa  249  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>