264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1073 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  100 
 
 		 299 aa  607  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  100 
 
 		 299 aa  607  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  98.22 
 
 		 300 aa  567  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  95.07 
 
 		 298 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6225  nitrogenase reductase  89.69 
 
 		 297 aa  539  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  91.46 
 
 		 298 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  91.46 
 
 		 299 aa  531  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  91.1 
 
 		 299 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  87.93 
 
 		 295 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  86.1 
 
 		 295 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  85.71 
 
 		 295 aa  525  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  82.43 
 
 		 296 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1246  nitrogenase reductase  88.69 
 
 		 312 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.944984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  82.43 
 
 		 296 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  82.64 
 
 		 293 aa  501  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0541  nitrogenase reductase  89.4 
 
 		 291 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1430  nitrogenase reductase  83.33 
 
 		 293 aa  498  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2192  nitrogenase reductase  89.4 
 
 		 291 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.866269  normal  0.548044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  81.6 
 
 		 293 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2345  nitrogenase reductase  82.98 
 
 		 296 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.383855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  81.6 
 
 		 303 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  84.31 
 
 		 290 aa  491  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  78.98 
 
 		 295 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  78.64 
 
 		 295 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  79.18 
 
 		 293 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7808  nitrogenase reductase  80.9 
 
 		 293 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3632  nitrogenase reductase  80.9 
 
 		 293 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7753  nitrogenase reductase  80.9 
 
 		 293 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  73.13 
 
 		 326 aa  447  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  76.9 
 
 		 324 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  74.06 
 
 		 296 aa  449  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  74.31 
 
 		 295 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  72.51 
 
 		 296 aa  441  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  74.23 
 
 		 297 aa  438  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  74.23 
 
 		 299 aa  431  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  71.79 
 
 		 287 aa  428  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  70.71 
 
 		 289 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  72.66 
 
 		 299 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  70.92 
 
 		 293 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  74.82 
 
 		 298 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  71.63 
 
 		 296 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  73.94 
 
 		 296 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  70.63 
 
 		 292 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  70.28 
 
 		 288 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  70.92 
 
 		 290 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  72.73 
 
 		 275 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  68.18 
 
 		 288 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  66.44 
 
 		 291 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  70.98 
 
 		 289 aa  407  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1785  nitrogenase iron protein  69.07 
 
 		 296 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1813  nitrogenase iron protein  69.07 
 
 		 296 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  73.12 
 
 		 288 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4136  nitrogenase iron protein subunit NifH  75.58 
 
 		 296 aa  405  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0109879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  69.55 
 
 		 289 aa  401  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  69.9 
 
 		 289 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  70.59 
 
 		 290 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  69.93 
 
 		 289 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  69.2 
 
 		 288 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  69.23 
 
 		 289 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  71.07 
 
 		 288 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  66.67 
 
 		 284 aa  378  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  62.18 
 
 		 275 aa  359  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  64.23 
 
 		 272 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  64.36 
 
 		 274 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  62.23 
 
 		 277 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  64.73 
 
 		 274 aa  352  4e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  63.37 
 
 		 276 aa  352  5e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  61.09 
 
 		 274 aa  349  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  61.01 
 
 		 276 aa  348  5e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  60.43 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  59.78 
 
 		 274 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  61.68 
 
 		 273 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  61.17 
 
 		 276 aa  340  2e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  60.95 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  61.68 
 
 		 273 aa  338  5e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  60.07 
 
 		 275 aa  338  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  60.79 
 
 		 280 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  60.58 
 
 		 275 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  59.49 
 
 		 275 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  59.85 
 
 		 275 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  62.91 
 
 		 274 aa  333  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  63.27 
 
 		 274 aa  333  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  62.55 
 
 		 274 aa  332  5e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  62.91 
 
 		 274 aa  332  5e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  58.39 
 
 		 275 aa  332  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  62.91 
 
 		 274 aa  331  8e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  57.82 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  57.09 
 
 		 275 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  58.76 
 
 		 275 aa  326  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  57.09 
 
 		 275 aa  326  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  57.82 
 
 		 275 aa  326  3e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  59.85 
 
 		 283 aa  325  5e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  56.32 
 
 		 275 aa  310  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  53.68 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  54.1 
 
 		 280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  51.47 
 
 		 270 aa  280  3e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  52.57 
 
 		 272 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  47.79 
 
 		 276 aa  266  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  47.44 
 
 		 289 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  49.62 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>