115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0962 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0962  protein of unknown function DUF1508  100 
 
 		 429 aa  884    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00273336  hitchhiker  0.000637648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  71.43 
 
 		 109 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4207  hypothetical protein  68.57 
 
 		 110 aa  150  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  65.42 
 
 		 110 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2608  hypothetical protein  66.04 
 
 		 109 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  55.56 
 
 		 111 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  51.72 
 
 		 127 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  57.43 
 
 		 111 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1092  hypothetical protein  53.92 
 
 		 110 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08081  hypothetical protein  51.92 
 
 		 107 aa  104  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.374785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3020  hypothetical protein  49.52 
 
 		 110 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0509462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  49.52 
 
 		 110 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  49.52 
 
 		 110 aa  103  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  49.52 
 
 		 110 aa  103  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  49.52 
 
 		 110 aa  103  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  49.52 
 
 		 110 aa  103  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  49.52 
 
 		 110 aa  103  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  49.52 
 
 		 110 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  56.18 
 
 		 110 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1576  protein of unknown function DUF1508  48.57 
 
 		 110 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3888  hypothetical protein  49.52 
 
 		 110 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3222  hypothetical protein  49.52 
 
 		 110 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000417954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1187  hypothetical protein  47.66 
 
 		 110 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.775575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0740  hypothetical protein  49.52 
 
 		 110 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  46.85 
 
 		 112 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0417  hypothetical protein  54.74 
 
 		 111 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3563  hypothetical protein  49.52 
 
 		 110 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1209  hypothetical protein  45.28 
 
 		 112 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3097  hypothetical protein  45.28 
 
 		 112 aa  99.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00116943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1326  hypothetical protein  45.28 
 
 		 112 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4181  hypothetical protein  45.71 
 
 		 110 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0400  hypothetical protein  46.39 
 
 		 110 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1304  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04300  hypothetical protein  44.33 
 
 		 110 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0421  hypothetical protein  43.3 
 
 		 110 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1562  protein of unknown function DUF1508  51.69 
 
 		 113 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0468  hypothetical protein  44.33 
 
 		 110 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2610  hypothetical protein  43.3 
 
 		 110 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0495  hypothetical protein  43.3 
 
 		 110 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0494  hypothetical protein  40.91 
 
 		 110 aa  84  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 667 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  28.96 
 
 		 459 aa  57  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  29.79 
 
 		 468 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  27.52 
 
 		 794 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  52.08 
 
 		 58 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.3 
 
 		 1094 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  22.48 
 
 		 969 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  50.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  22.15 
 
 		 971 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  50.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.03 
 
 		 1055 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1724  hypothetical protein  37.68 
 
 		 126 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772507  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  28.07 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  28.07 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  41.18 
 
 		 64 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  29.37 
 
 		 760 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  28.21 
 
 		 725 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  30.19 
 
 		 513 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  26.4 
 
 		 1020 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.97 
 
 		 1014 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.85 
 
 		 672 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.78 
 
 		 656 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  31.82 
 
 		 593 aa  47.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.58 
 
 		 657 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  25.5 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  33.96 
 
 		 1198 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.1 
 
 		 656 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  41.67 
 
 		 101 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  26.81 
 
 		 741 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.85 
 
 		 1053 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0786  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.47 
 
 		 539 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  26.92 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  29.84 
 
 		 515 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  30.65 
 
 		 518 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  25.96 
 
 		 740 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.03 
 
 		 737 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  27.82 
 
 		 514 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  23.12 
 
 		 665 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 		 702 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  26.89 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  40.82 
 
 		 62 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.93 
 
 		 723 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  28.78 
 
 		 582 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  40.82 
 
 		 62 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0154  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.32 
 
 		 692 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.152136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  30.3 
 
 		 911 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  24.85 
 
 		 1119 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  26.7 
 
 		 701 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  28.91 
 
 		 358 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  27.61 
 
 		 903 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.2 
 
 		 528 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 		 759 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  29.77 
 
 		 645 aa  43.9  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.67 
 
 		 758 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  53.19 
 
 		 62 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  53.19 
 
 		 61 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>