56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0417 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0417  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  230  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  56.76 
 
 
111 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  55 
 
 
109 aa  116  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  53.7 
 
 
112 aa  111  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3563  hypothetical protein  53.15 
 
 
110 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3888  hypothetical protein  53.15 
 
 
110 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0740  hypothetical protein  53.15 
 
 
110 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3222  hypothetical protein  53.15 
 
 
110 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000417954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  51.79 
 
 
110 aa  107  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0468  hypothetical protein  48.18 
 
 
110 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4207  hypothetical protein  53.54 
 
 
110 aa  107  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56758  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2610  hypothetical protein  49.09 
 
 
110 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0495  hypothetical protein  49.09 
 
 
110 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  47.75 
 
 
127 aa  104  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1092  hypothetical protein  48.65 
 
 
110 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1304  hypothetical protein  50.45 
 
 
114 aa  103  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542038  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  48.65 
 
 
110 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  48.65 
 
 
110 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  48.65 
 
 
110 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  48.65 
 
 
110 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  48.65 
 
 
110 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  48.65 
 
 
110 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  48.65 
 
 
110 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1562  protein of unknown function DUF1508  46.79 
 
 
113 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3020  hypothetical protein  47.75 
 
 
110 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0509462 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1576  protein of unknown function DUF1508  48.65 
 
 
110 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  51.04 
 
 
110 aa  100  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0962  protein of unknown function DUF1508  54.74 
 
 
429 aa  100  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00273336  hitchhiker  0.000637648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0400  hypothetical protein  46.36 
 
 
110 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4181  hypothetical protein  49.54 
 
 
110 aa  100  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3097  hypothetical protein  49.07 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00116943  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1209  hypothetical protein  49.07 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359966  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1326  hypothetical protein  49.07 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08081  hypothetical protein  46.23 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.374785  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  41.82 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1187  hypothetical protein  49.51 
 
 
110 aa  90.9  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.775575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0421  hypothetical protein  41.28 
 
 
110 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04300  hypothetical protein  42.2 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900258  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2608  hypothetical protein  46.39 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1772  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0494  hypothetical protein  41.44 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  44.23 
 
 
58 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2531  protein of unknown function DUF1508  50 
 
 
57 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  37.29 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  37.29 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2330  protein of unknown function DUF1508  52.08 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  37.29 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  32.81 
 
 
64 aa  44.3  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  34.69 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  37.25 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  32.14 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  30 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  32.69 
 
 
523 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  32.2 
 
 
214 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2449  protein of unknown function DUF1508  31.03 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  32.04 
 
 
509 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  29.6 
 
 
224 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>