53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1304 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1304  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542038  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1576  protein of unknown function DUF1508  67.27 
 
 		 110 aa  156  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  66.36 
 
 		 110 aa  154  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  66.36 
 
 		 110 aa  154  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3020  hypothetical protein  66.36 
 
 		 110 aa  154  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0509462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  66.36 
 
 		 110 aa  154  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  66.36 
 
 		 110 aa  154  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  66.36 
 
 		 110 aa  154  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  66.36 
 
 		 110 aa  154  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  66.36 
 
 		 110 aa  154  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3222  hypothetical protein  67.27 
 
 		 110 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000417954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3888  hypothetical protein  67.27 
 
 		 110 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0740  hypothetical protein  67.27 
 
 		 110 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0494  hypothetical protein  60.91 
 
 		 110 aa  149  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3563  hypothetical protein  67.27 
 
 		 110 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1187  hypothetical protein  59.26 
 
 		 110 aa  137  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.775575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1326  hypothetical protein  61.47 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3097  hypothetical protein  61.47 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00116943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1209  hypothetical protein  61.47 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359966  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4181  hypothetical protein  59.26 
 
 		 110 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  58.49 
 
 		 112 aa  126  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0495  hypothetical protein  56.86 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2610  hypothetical protein  56.86 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332425  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0468  hypothetical protein  55.88 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4207  hypothetical protein  53.7 
 
 		 110 aa  120  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  53.64 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0400  hypothetical protein  52.94 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2608  hypothetical protein  50.47 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  47.79 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  46.23 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08081  hypothetical protein  50.94 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.374785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  48.62 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0417  hypothetical protein  50.45 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1092  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  45.45 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0962  protein of unknown function DUF1508  47.96 
 
 		 429 aa  89.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00273336  hitchhiker  0.000637648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0421  hypothetical protein  41.82 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  45 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04300  hypothetical protein  41.82 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1562  protein of unknown function DUF1508  45.92 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  39.22 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  38 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  38.3 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3605  hypothetical protein  29 
 
 		 863 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000881284 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  34.04 
 
 		 62 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2531  protein of unknown function DUF1508  44.19 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2449  protein of unknown function DUF1508  34.78 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  28.32 
 
 		 523 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  34.04 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  41.51 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  32.79 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  41.51 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  42.31 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>