43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1562 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1562  protein of unknown function DUF1508  100 
 
 		 113 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  55.05 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1092  hypothetical protein  55.45 
 
 		 110 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0417  hypothetical protein  46.79 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  49.09 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0400  hypothetical protein  50.93 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0468  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4207  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56758  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2610  hypothetical protein  49.07 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0495  hypothetical protein  49.07 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  47.27 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  47.96 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  50 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0962  protein of unknown function DUF1508  51.69 
 
 		 429 aa  87.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00273336  hitchhiker  0.000637648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1326  hypothetical protein  48.98 
 
 		 112 aa  87  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3097  hypothetical protein  48.98 
 
 		 112 aa  87  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00116943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1209  hypothetical protein  48.98 
 
 		 112 aa  87  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  40.37 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  46.3 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  46.3 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  46.3 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  46.3 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1576  protein of unknown function DUF1508  46.3 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  46.3 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  46.3 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  46.3 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2608  hypothetical protein  45.83 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3020  hypothetical protein  45.37 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0509462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0740  hypothetical protein  46 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1187  hypothetical protein  43 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.775575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3888  hypothetical protein  46 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3222  hypothetical protein  46 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000417954 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4181  hypothetical protein  45.63 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08081  hypothetical protein  43.93 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.374785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0421  hypothetical protein  43.16 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04300  hypothetical protein  40.62 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3563  hypothetical protein  45 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1304  hypothetical protein  45.92 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  38.89 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0494  hypothetical protein  35.29 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2531  protein of unknown function DUF1508  53.85 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  41.18 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  38.78 
 
 		 62 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>