77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2613 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  221  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  67.27 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  62.39 
 
 		 111 aa  140  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4207  hypothetical protein  57.94 
 
 		 110 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56758  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  57.01 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  57.27 
 
 		 111 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  56.73 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1092  hypothetical protein  60.91 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0468  hypothetical protein  54.13 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2608  hypothetical protein  55.24 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0400  hypothetical protein  54.13 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0495  hypothetical protein  53.21 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2610  hypothetical protein  53.21 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332425  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3020  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0509462 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08081  hypothetical protein  55.66 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.374785  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1187  hypothetical protein  59 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.775575  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1576  protein of unknown function DUF1508  51.82 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0421  hypothetical protein  54.63 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0740  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3222  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000417954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3888  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0417  hypothetical protein  51.79 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3563  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04300  hypothetical protein  53.7 
 
 		 110 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4181  hypothetical protein  49.07 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0962  protein of unknown function DUF1508  56.18 
 
 		 429 aa  102  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00273336  hitchhiker  0.000637648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  48.11 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1326  hypothetical protein  48.11 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1209  hypothetical protein  48.11 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3097  hypothetical protein  48.11 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00116943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1304  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1562  protein of unknown function DUF1508  49.09 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0494  hypothetical protein  49.48 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  42.24 
 
 		 523 aa  77.4  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  59.32 
 
 		 62 aa  69.3  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  69.57 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  37.72 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  59.65 
 
 		 58 aa  68.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  43.02 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  67.39 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  38.58 
 
 		 224 aa  67  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  66.67 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  56.45 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  58 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1784  hypothetical protein  61.22 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0566644  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  64.71 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2679  hypothetical protein  61.22 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  40 
 
 		 557 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  34.4 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2449  protein of unknown function DUF1508  50 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2330  protein of unknown function DUF1508  56.6 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2531  protein of unknown function DUF1508  53.85 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3815  hypothetical protein  50.91 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3605  hypothetical protein  35.23 
 
 		 863 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000881284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6482  hypothetical protein  46.67 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.068016  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0972  hypothetical protein  51.02 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.859574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7233  protein of unknown function DUF1508  48.89 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4130  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2960  protein of unknown function DUF1508  43.75 
 
 		 298 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1133  hypothetical protein  48.98 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.433125  normal  0.699348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2572  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259353  normal  0.786456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0075  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2504  protein of unknown function DUF1508  42.86 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2795  protein of unknown function DUF1508  42.86 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0497827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4321  hypothetical protein  46.15 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 449 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3547  protein of unknown function DUF1508  44.23 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0562  protein of unknown function DUF1508  41.18 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5390  protein of unknown function DUF1508  32.61 
 
 		 226 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1084  hypothetical protein  44.9 
 
 		 60 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>