74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1089 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  95.08 
 
 		 62 aa  124  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  90.16 
 
 		 62 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  65.38 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2330  protein of unknown function DUF1508  56.9 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  54.39 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  55.93 
 
 		 58 aa  67.8  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0972  hypothetical protein  56.36 
 
 		 56 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.859574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  53.45 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  55.17 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  52.63 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  50 
 
 		 509 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0562  protein of unknown function DUF1508  51.85 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  50 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  62.75 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2960  protein of unknown function DUF1508  48.21 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  64.71 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7233  protein of unknown function DUF1508  50.88 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  50.88 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  52 
 
 		 557 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  52.73 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3815  hypothetical protein  47.37 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  47.37 
 
 		 523 aa  60.5  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2679  hypothetical protein  55 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  57.69 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2504  protein of unknown function DUF1508  47.37 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2795  protein of unknown function DUF1508  47.37 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0497827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2572  hypothetical protein  47.37 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259353  normal  0.786456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1784  hypothetical protein  49.12 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0566644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6482  hypothetical protein  45.61 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.068016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3547  protein of unknown function DUF1508  43.64 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2449  protein of unknown function DUF1508  42.62 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1640  protein of unknown function DUF1508  42 
 
 		 956 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  56.25 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4207  hypothetical protein  58.33 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1092  hypothetical protein  56.86 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2608  hypothetical protein  51.79 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1927  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062835  decreased coverage  0.000000000000486624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0066  hypothetical protein  42.11 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0421  hypothetical protein  50.98 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5390  protein of unknown function DUF1508  34.55 
 
 		 226 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2678  hypothetical protein  33.33 
 
 		 969 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1074  protein of unknown function DUF1508  33.33 
 
 		 1001 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0468  hypothetical protein  45.28 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0417  hypothetical protein  37.29 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0963  hypothetical protein  40 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0640567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04300  hypothetical protein  49.02 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3020  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0509462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0962  protein of unknown function DUF1508  53.19 
 
 		 429 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00273336  hitchhiker  0.000637648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  50 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3563  hypothetical protein  43.4 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0740  hypothetical protein  43.4 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0495  hypothetical protein  45.28 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3222  hypothetical protein  43.4 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000417954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2610  hypothetical protein  45.28 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332425  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1084  hypothetical protein  43.33 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3888  hypothetical protein  43.4 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08081  hypothetical protein  45.61 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.374785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1326  hypothetical protein  45.83 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3097  hypothetical protein  45.83 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00116943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  47.92 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1209  hypothetical protein  45.83 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1187  hypothetical protein  46.15 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.775575  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1576  protein of unknown function DUF1508  48.08 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0075  hypothetical protein  36.67 
 
 		 135 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1304  hypothetical protein  41.51 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1378  hypothetical protein  35.48 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>