49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0423 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  100 
 
 
214 aa  430  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  60.85 
 
 
224 aa  265  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  52.27 
 
 
557 aa  137  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  43.88 
 
 
509 aa  112  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  44.09 
 
 
523 aa  111  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0562  protein of unknown function DUF1508  34.15 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3547  protein of unknown function DUF1508  36.13 
 
 
166 aa  85.9  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1640  protein of unknown function DUF1508  31.45 
 
 
956 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2678  hypothetical protein  28.57 
 
 
969 aa  72.4  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4120  protein of unknown function DUF1508  28.81 
 
 
872 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2330  protein of unknown function DUF1508  55 
 
 
64 aa  69.3  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1074  protein of unknown function DUF1508  29.55 
 
 
1001 aa  69.3  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2960  protein of unknown function DUF1508  54.72 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  54.39 
 
 
62 aa  68.6  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  54.39 
 
 
61 aa  68.6  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  52.63 
 
 
62 aa  68.2  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  30.89 
 
 
127 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2572  hypothetical protein  46.43 
 
 
61 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259353  normal  0.786456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2504  protein of unknown function DUF1508  46.43 
 
 
61 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2795  protein of unknown function DUF1508  46.43 
 
 
61 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0497827  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  34.4 
 
 
110 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3815  hypothetical protein  51.06 
 
 
61 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272281  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7233  protein of unknown function DUF1508  48.21 
 
 
61 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  44.64 
 
 
101 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  38.6 
 
 
62 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_004310  BR0972  hypothetical protein  42.59 
 
 
56 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.859574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6482  hypothetical protein  42.86 
 
 
61 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.068016  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  31.4 
 
 
111 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5390  protein of unknown function DUF1508  43.48 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  36.84 
 
 
62 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  28.93 
 
 
111 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2679  hypothetical protein  33.93 
 
 
58 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1108  hypothetical protein  32.53 
 
 
95 aa  45.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  40.74 
 
 
64 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  46.3 
 
 
58 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  30.58 
 
 
109 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2449  protein of unknown function DUF1508  38.46 
 
 
61 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1576  protein of unknown function DUF1508  31.3 
 
 
110 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3020  hypothetical protein  31.3 
 
 
110 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0509462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  31.3 
 
 
110 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2059  hypothetical protein  35.09 
 
 
84 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  31.3 
 
 
110 aa  42.4  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  31.3 
 
 
110 aa  42.4  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  31.3 
 
 
110 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  31.3 
 
 
110 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  31.3 
 
 
110 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  31.3 
 
 
110 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0417  hypothetical protein  32.2 
 
 
111 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2608  hypothetical protein  30.09 
 
 
109 aa  41.6  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1772  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>