22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1074 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4120  protein of unknown function DUF1508  48.47 
 
 
872 aa  692    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1074  protein of unknown function DUF1508  100 
 
 
1001 aa  2002    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2678  hypothetical protein  73.86 
 
 
969 aa  1405    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1640  protein of unknown function DUF1508  39.7 
 
 
956 aa  643    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  24.76 
 
 
523 aa  148  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  28.53 
 
 
557 aa  132  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  23.49 
 
 
509 aa  128  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2614  hypothetical protein  33.82 
 
 
329 aa  71.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3587  putative permease  34.48 
 
 
314 aa  70.1  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1802  hypothetical protein  33.78 
 
 
299 aa  70.1  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  29.55 
 
 
214 aa  69.3  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1116  hypothetical protein  33.63 
 
 
352 aa  65.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0507889  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  27.59 
 
 
224 aa  65.1  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0443  putative permease  28.87 
 
 
325 aa  60.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0562  protein of unknown function DUF1508  38.46 
 
 
211 aa  58.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1649  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  52  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.313599  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2960  protein of unknown function DUF1508  42.86 
 
 
298 aa  51.2  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3188  hypothetical protein  32.62 
 
 
338 aa  50.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.517145  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  35 
 
 
62 aa  48.5  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3547  protein of unknown function DUF1508  38.89 
 
 
166 aa  47.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  33.33 
 
 
61 aa  46.2  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  31.58 
 
 
62 aa  45.4  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>