13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0443 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0443  putative permease  100 
 
 
325 aa  640    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3587  putative permease  39.11 
 
 
314 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1802  hypothetical protein  37.46 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1640  protein of unknown function DUF1508  33.09 
 
 
956 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2614  hypothetical protein  27.61 
 
 
329 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2678  hypothetical protein  28.78 
 
 
969 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0232  hypothetical protein  29.85 
 
 
288 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.566841  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1074  protein of unknown function DUF1508  30.5 
 
 
1001 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1116  hypothetical protein  26.67 
 
 
352 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0507889  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  31.15 
 
 
557 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  26.74 
 
 
523 aa  46.6  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3188  hypothetical protein  37.93 
 
 
338 aa  46.2  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.517145  normal  0.142613 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  28.99 
 
 
509 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>