12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1108 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1108  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  186  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2013  hypothetical protein  73.08 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1881  hypothetical protein  65.91 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.132481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0265  hypothetical protein  59.38 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0909482  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2250  hypothetical protein  65.57 
 
 
96 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0573  hypothetical protein  48.1 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0436  hypothetical protein  32.89 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.947732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1660  hypothetical protein  36.05 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.411815  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  37.04 
 
 
224 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  32.53 
 
 
214 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0562  protein of unknown function DUF1508  36.71 
 
 
211 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3547  protein of unknown function DUF1508  41.67 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>