59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2372 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  224  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  224  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  224  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  224  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  224  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  224  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  224  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1576  protein of unknown function DUF1508  99.09 
 
 
110 aa  223  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3020  hypothetical protein  99.09 
 
 
110 aa  222  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0509462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0494  hypothetical protein  70 
 
 
110 aa  164  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1187  hypothetical protein  71.3 
 
 
110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.775575  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1304  hypothetical protein  66.36 
 
 
114 aa  154  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542038  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3888  hypothetical protein  65.45 
 
 
110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0740  hypothetical protein  65.45 
 
 
110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3222  hypothetical protein  65.45 
 
 
110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000417954 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4181  hypothetical protein  64.81 
 
 
110 aa  150  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3563  hypothetical protein  65.45 
 
 
110 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0468  hypothetical protein  61.22 
 
 
110 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2610  hypothetical protein  60.2 
 
 
110 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0495  hypothetical protein  60.2 
 
 
110 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  54.55 
 
 
111 aa  120  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3097  hypothetical protein  54.63 
 
 
112 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00116943  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1326  hypothetical protein  54.63 
 
 
112 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1209  hypothetical protein  54.63 
 
 
112 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4207  hypothetical protein  53.7 
 
 
110 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56758  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08081  hypothetical protein  55.66 
 
 
107 aa  116  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.374785  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0400  hypothetical protein  55.1 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  52.83 
 
 
112 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  51.89 
 
 
109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  48.18 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  52.73 
 
 
110 aa  110  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  53.06 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2608  hypothetical protein  50 
 
 
109 aa  107  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1772  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0421  hypothetical protein  55.1 
 
 
110 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1092  hypothetical protein  48.18 
 
 
110 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04300  hypothetical protein  55.1 
 
 
110 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900258  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0962  protein of unknown function DUF1508  49.52 
 
 
429 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00273336  hitchhiker  0.000637648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0417  hypothetical protein  48.65 
 
 
111 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  47.17 
 
 
111 aa  100  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1562  protein of unknown function DUF1508  46.3 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  57.69 
 
 
58 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  54 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3605  hypothetical protein  30.61 
 
 
863 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000881284 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2531  protein of unknown function DUF1508  54.55 
 
 
57 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  43.1 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  46.81 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  46 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1046  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  32.99 
 
 
895 aa  47  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  39.34 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2449  protein of unknown function DUF1508  43.48 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0099  hypothetical protein  46.81 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2679  hypothetical protein  44.44 
 
 
58 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1784  hypothetical protein  48.89 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0566644  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  31.3 
 
 
214 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  48.08 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1724  hypothetical protein  25.47 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772507  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3652  hypothetical protein  42.55 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>