41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2679 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2679  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1133  hypothetical protein  77.78 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.433125  normal  0.699348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1084  hypothetical protein  67.24 
 
 		 60 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4321  hypothetical protein  72.41 
 
 		 59 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  66.67 
 
 		 62 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  64.91 
 
 		 62 aa  76.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  61.4 
 
 		 62 aa  70.1  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  56.86 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  61.22 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  53.33 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  55 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  55 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  55.1 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1784  hypothetical protein  58 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0566644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  50.88 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  50.88 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  46.3 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  47.06 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  42.59 
 
 		 509 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  40.74 
 
 		 523 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  33.93 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  37.5 
 
 		 224 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2449  protein of unknown function DUF1508  36.84 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  45.65 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3020  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0509462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1326  hypothetical protein  46.81 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  47.83 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3097  hypothetical protein  46.81 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00116943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1209  hypothetical protein  46.81 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4207  hypothetical protein  45.65 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56758  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1576  protein of unknown function DUF1508  42.59 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  42.55 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0421  hypothetical protein  44.9 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2330  protein of unknown function DUF1508  38.6 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>