14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4321 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4321  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1084  hypothetical protein  74.14 
 
 
60 aa  93.6  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1133  hypothetical protein  78.57 
 
 
83 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.433125  normal  0.699348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2679  hypothetical protein  72.41 
 
 
58 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  52.63 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  54.39 
 
 
62 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  50.88 
 
 
62 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  48.08 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  48.08 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2610  hypothetical protein  41.18 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0495  hypothetical protein  41.18 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  46.15 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0468  hypothetical protein  41.18 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0400  hypothetical protein  41.18 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>