52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0400 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0400  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  226  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0468  hypothetical protein  87.27 
 
 		 110 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2610  hypothetical protein  86.24 
 
 		 110 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0495  hypothetical protein  86.24 
 
 		 110 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  58.72 
 
 		 111 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  54.13 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4181  hypothetical protein  55.45 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3020  hypothetical protein  55.1 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0509462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  55.1 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  55.1 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  55.1 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  55.1 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  55.1 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  55.1 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  55.1 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1576  protein of unknown function DUF1508  55.1 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1304  hypothetical protein  52.94 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1187  hypothetical protein  53.77 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.775575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  54.13 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1092  hypothetical protein  54.13 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3222  hypothetical protein  48.62 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000417954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0740  hypothetical protein  48.62 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3888  hypothetical protein  48.62 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  49.07 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3563  hypothetical protein  48.62 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  49.51 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4207  hypothetical protein  50.94 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56758  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1326  hypothetical protein  51.43 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3097  hypothetical protein  51.43 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00116943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1209  hypothetical protein  51.43 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0421  hypothetical protein  51.85 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0494  hypothetical protein  51.02 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04300  hypothetical protein  50.93 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08081  hypothetical protein  47.17 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.374785  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0417  hypothetical protein  46.36 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2608  hypothetical protein  47.22 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  44.95 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1562  protein of unknown function DUF1508  50.93 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0962  protein of unknown function DUF1508  46.39 
 
 		 429 aa  90.5  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00273336  hitchhiker  0.000637648 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  52.94 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  50 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  41.67 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  41.27 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  39.58 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  32.48 
 
 		 509 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  39.22 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2531  protein of unknown function DUF1508  45.83 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2449  protein of unknown function DUF1508  39.13 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3652  hypothetical protein  44 
 
 		 112 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4321  hypothetical protein  41.18 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  28.81 
 
 		 523 aa  40.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>