50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1092 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1092  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  221  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  63.64 
 
 		 111 aa  144  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4207  hypothetical protein  59.26 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56758  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  60.91 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  54.63 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  55.45 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4181  hypothetical protein  54.63 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2610  hypothetical protein  52.29 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0495  hypothetical protein  52.29 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0468  hypothetical protein  52.29 
 
 		 110 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  52.78 
 
 		 112 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0400  hypothetical protein  54.13 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08081  hypothetical protein  51.89 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.374785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3888  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3222  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000417954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04300  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0740  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3563  hypothetical protein  47.27 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  50.98 
 
 		 110 aa  106  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0421  hypothetical protein  49.07 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230068  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1187  hypothetical protein  53.27 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.775575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  51.38 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3020  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0509462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0962  protein of unknown function DUF1508  53.92 
 
 		 429 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00273336  hitchhiker  0.000637648 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1576  protein of unknown function DUF1508  47.27 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3097  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00116943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1209  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359966  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1326  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0417  hypothetical protein  48.65 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1562  protein of unknown function DUF1508  55.45 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2608  hypothetical protein  50.94 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1304  hypothetical protein  48.18 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0494  hypothetical protein  42.99 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  55.77 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  52 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  56.86 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  56.86 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  54.9 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2531  protein of unknown function DUF1508  47.83 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1784  hypothetical protein  48.98 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0566644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  47.83 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  47.83 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  46.94 
 
 		 64 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>