19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1724 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1724  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  243  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2466  protein of unknown function DUF1508  30.48 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675831  normal  0.26549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2608  hypothetical protein  32.71 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1772  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  29.36 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4207  hypothetical protein  29.09 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0962  protein of unknown function DUF1508  37.68 
 
 
429 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00273336  hitchhiker  0.000637648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  27.36 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3888  hypothetical protein  27.78 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0740  hypothetical protein  27.78 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3222  hypothetical protein  27.78 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000417954 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  29.9 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3563  hypothetical protein  26.85 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  25.47 
 
 
110 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  25.47 
 
 
110 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  25.47 
 
 
110 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  25.47 
 
 
110 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  25.47 
 
 
110 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  25.47 
 
 
110 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  25.47 
 
 
110 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>