More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2624 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2624  signal peptidase II  100 
 
 		 111 aa  221  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  96.25 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  57.14 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  59.42 
 
 		 364 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  47.95 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  47.22 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  53.03 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  43.53 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  51.32 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  57.81 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  56.36 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  56.36 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  56.36 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  58.18 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  56.36 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  56.36 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  54.24 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  56.36 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  58.18 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  49.23 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  56.36 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  56.36 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  58.18 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  57.81 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  43.66 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  54.55 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  56.25 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  56.25 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  56.36 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  56.25 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  54.55 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  52.86 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  56.25 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  56.36 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  56.25 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  56.25 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  56.25 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  56.36 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  49.21 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  58.82 
 
 		 173 aa  72  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  53.73 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  53.73 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  53.73 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  53.73 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  53.73 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  53.73 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  53.73 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  62.26 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  55.56 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  53.85 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  47.89 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  47.89 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  55.56 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  46.03 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  51.43 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  51.72 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  53.12 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  52.38 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  51.72 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  51.72 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  51.72 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  46.77 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  46.03 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  52.94 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  57.89 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  57.89 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 173 aa  70.1  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  46.88 
 
 		 169 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  52.54 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  46.48 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  57.14 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  56.86 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  44.78 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  53.23 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  57.89 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  57.89 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  57.89 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  56.86 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  57.89 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  57.89 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  50.85 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0557  signal peptidase II  41.94 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2691  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  59.62 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  56.86 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  47.46 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  46.88 
 
 		 170 aa  66.6  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>