83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1018 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  61.69 
 
 
274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  49.81 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  51.95 
 
 
244 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  50.58 
 
 
240 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  51.08 
 
 
249 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0417  hypothetical protein  31.89 
 
 
311 aa  98.2  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  32.39 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2661  hypothetical protein  29.15 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00378  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.138216  normal  0.0706164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2722  hypothetical protein  33.81 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.904105  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2180  hypothetical protein  26.19 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89503  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2832  hypothetical protein  25.69 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3068  hypothetical protein  24.3 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3082  hypothetical protein  25.69 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1151  hypothetical protein  28.77 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  33.14 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2860  hypothetical protein  24.7 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3073  hypothetical protein  24.7 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.586604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3101  hypothetical protein  24.71 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  30.56 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2853  hypothetical protein  24.3 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3098  hypothetical protein  24.71 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2792  hypothetical protein  25.3 
 
 
265 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  28.79 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  28.64 
 
 
266 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0283  hypothetical protein  23.83 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.162639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  31.43 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3013  hypothetical protein  31.64 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2048  hypothetical protein  22.62 
 
 
267 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.128693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0595  hypothetical protein  27.66 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  37.33 
 
 
229 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  27.61 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  27.13 
 
 
286 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  30.93 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  26.88 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  30.56 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  33.99 
 
 
216 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2427  hypothetical protein  28.34 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  49.25 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  49.25 
 
 
231 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  27.6 
 
 
286 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  28.08 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  37.5 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  28.89 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  47.76 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  40.57 
 
 
212 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  50 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  42.86 
 
 
219 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  47.62 
 
 
230 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.89 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  49.12 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  47.76 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  46.03 
 
 
230 aa  45.4  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  32.21 
 
 
212 aa  45.4  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  49.02 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01720  hypothetical protein  28.42 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  38.24 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.36 
 
 
135 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1845  hypothetical protein  26.67 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0222283  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  30.09 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  42.47 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  47.37 
 
 
230 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  47.17 
 
 
204 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  38.57 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  38.82 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  49.02 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22130  hypothetical protein  25 
 
 
205 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0137197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  31.65 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  44.59 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  30.05 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  47.37 
 
 
227 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  47.37 
 
 
227 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  47.37 
 
 
264 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  47.37 
 
 
264 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  47.37 
 
 
227 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  47.37 
 
 
227 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  44.44 
 
 
206 aa  42.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  35.29 
 
 
239 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  31.49 
 
 
297 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34085  predicted protein  42.59 
 
 
512 aa  42  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  47.37 
 
 
291 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>