31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01720 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_01720  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  430  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0473  hypothetical protein  58.26 
 
 
212 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1359  hypothetical protein  55.05 
 
 
212 aa  245  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000393544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1316  hypothetical protein  55.09 
 
 
210 aa  243  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06030  hypothetical protein  54.09 
 
 
216 aa  239  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4303  hypothetical protein  50.68 
 
 
216 aa  195  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0361171  normal  0.12147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5302  hypothetical protein  48.86 
 
 
214 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  34.96 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3068  hypothetical protein  29.33 
 
 
265 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2860  hypothetical protein  28 
 
 
265 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193154  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3082  hypothetical protein  28 
 
 
265 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2832  hypothetical protein  28 
 
 
265 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3073  hypothetical protein  28 
 
 
265 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.586604  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  31.76 
 
 
266 aa  55.1  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2180  hypothetical protein  26.85 
 
 
265 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89503  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3101  hypothetical protein  26.29 
 
 
265 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2792  hypothetical protein  27.33 
 
 
265 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2853  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3098  hypothetical protein  26.97 
 
 
265 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3052  hypothetical protein  26.19 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.140554 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0283  hypothetical protein  23.57 
 
 
267 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.162639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1151  hypothetical protein  24.03 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  42.11 
 
 
239 aa  45.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  28.42 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2048  hypothetical protein  25.76 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.128693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  42.11 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34085  predicted protein  23.83 
 
 
512 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  42.11 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2305  hypothetical protein  29.49 
 
 
238 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  26.87 
 
 
227 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3278  hypothetical protein  26.67 
 
 
223 aa  41.6  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>