56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2508 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  75.11 
 
 		 225 aa  342  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1214  hypothetical protein  55.6 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.835454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  57.52 
 
 		 227 aa  257  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  58.26 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  57.83 
 
 		 230 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  57.83 
 
 		 230 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  57.58 
 
 		 231 aa  246  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  57.58 
 
 		 256 aa  246  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  57.39 
 
 		 230 aa  244  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  57.14 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  54.82 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  55.7 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  55.7 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  55.26 
 
 		 264 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  55.26 
 
 		 227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  55.26 
 
 		 227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  55.26 
 
 		 227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1156  hypothetical protein  54.82 
 
 		 227 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  44.64 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  40.72 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  39.29 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  42.08 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  36.32 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  39.27 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  35.11 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  38 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  35.29 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  39.21 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  37.14 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  38.29 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  37.97 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  37.28 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  36.04 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0735  hypothetical protein  39.73 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  37.17 
 
 		 212 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  33.48 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  40.54 
 
 		 200 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2439  hypothetical protein  40.81 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872565  hitchhiker  0.00642281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2751  hypothetical protein  49.32 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  33.67 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34085  predicted protein  26.01 
 
 		 512 aa  55.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  36.23 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1359  hypothetical protein  34.02 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000393544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1316  hypothetical protein  33.68 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06030  hypothetical protein  31.78 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4303  hypothetical protein  35.05 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0361171  normal  0.12147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  42.11 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  42.47 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0473  hypothetical protein  44.07 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5302  hypothetical protein  37.93 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01720  hypothetical protein  42.11 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  27.85 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  36.17 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  36.05 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  30.67 
 
 		 240 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>