46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2267 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  96.09 
 
 		 230 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  89.57 
 
 		 230 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  90.48 
 
 		 231 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  90.48 
 
 		 231 aa  400  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  90.48 
 
 		 256 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  83.04 
 
 		 230 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  70.87 
 
 		 289 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  66.96 
 
 		 227 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1214  hypothetical protein  64.38 
 
 		 233 aa  310  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.835454 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  72.61 
 
 		 264 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  72.61 
 
 		 227 aa  304  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  72.61 
 
 		 227 aa  304  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  72.61 
 
 		 227 aa  304  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  70 
 
 		 264 aa  304  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  72.17 
 
 		 227 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1156  hypothetical protein  71.3 
 
 		 227 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  58.26 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  57.39 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  43.81 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  42.6 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  40.17 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  36 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  37.08 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  38.33 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  35.87 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  43.3 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  40 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0735  hypothetical protein  41.18 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  40.87 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  33.63 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  37.76 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  36.13 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  38.86 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  36.61 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  33.51 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2439  hypothetical protein  38.16 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872565  hitchhiker  0.00642281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  37.78 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2751  hypothetical protein  46.84 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  34.18 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  47.62 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  44.44 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34085  predicted protein  24.47 
 
 		 512 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06030  hypothetical protein  43.1 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1316  hypothetical protein  27.92 
 
 		 210 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>