46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3311 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  41.53 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  39.81 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  35.02 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  36.92 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  37.21 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  35.05 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  34.22 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  33.77 
 
 		 227 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  35.11 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  35.07 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0735  hypothetical protein  37.74 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  37.97 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  34.08 
 
 		 212 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1214  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.835454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  34.36 
 
 		 230 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  30.88 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  35.57 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  34.75 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  33.63 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  32.11 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  34.36 
 
 		 231 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  34.36 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  34.78 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  33.19 
 
 		 230 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  34.36 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  33.04 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  33.88 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  33.19 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  36.02 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  33.05 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2439  hypothetical protein  34.6 
 
 		 200 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872565  hitchhiker  0.00642281 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  33.04 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  33.04 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  33.04 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  33.04 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  32.47 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  32.47 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1156  hypothetical protein  32.14 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2751  hypothetical protein  39.73 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  26.58 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4303  hypothetical protein  26.67 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0361171  normal  0.12147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  35.14 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  36.36 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  38.82 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  36.49 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>