58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1059 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  61.69 
 
 
263 aa  288  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  51.15 
 
 
260 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  50.19 
 
 
244 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  48.67 
 
 
240 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  48.97 
 
 
249 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0417  hypothetical protein  35.82 
 
 
311 aa  102  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  32.14 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2048  hypothetical protein  26.74 
 
 
267 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.128693  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2661  hypothetical protein  29 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3101  hypothetical protein  25.98 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3068  hypothetical protein  25.88 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2853  hypothetical protein  25.2 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2180  hypothetical protein  25.78 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89503  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00378  conserved hypothetical protein  29.71 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.138216  normal  0.0706164 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3082  hypothetical protein  25.78 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  28.24 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2832  hypothetical protein  25.78 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3073  hypothetical protein  25.78 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.586604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2860  hypothetical protein  25.78 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193154  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3098  hypothetical protein  24.8 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  30.51 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2792  hypothetical protein  25.39 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2722  hypothetical protein  32.99 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.904105  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  37.93 
 
 
229 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  30.32 
 
 
266 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3013  hypothetical protein  32.32 
 
 
230 aa  59.7  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1151  hypothetical protein  28.02 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  27.31 
 
 
278 aa  59.3  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  33.82 
 
 
204 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  31.1 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0283  hypothetical protein  25.26 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.162639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  28.37 
 
 
286 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22130  hypothetical protein  26.6 
 
 
205 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0137197 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  33.11 
 
 
216 aa  48.9  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  26.19 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0595  hypothetical protein  26.9 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  28.74 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.02 
 
 
289 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  27.46 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  29.31 
 
 
296 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  47.83 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  47.83 
 
 
256 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  31.62 
 
 
238 aa  45.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  39.19 
 
 
219 aa  45.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  29.41 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  47.83 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  46.55 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  42.11 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2427  hypothetical protein  24.81 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  33.83 
 
 
200 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0032  hypothetical protein  24.15 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  46.38 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06030  hypothetical protein  30.5 
 
 
216 aa  43.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  44.44 
 
 
230 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  28.25 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  36.49 
 
 
246 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  46.3 
 
 
206 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>