43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1036 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  567  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  90.18 
 
 		 285 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  65.85 
 
 		 285 aa  362  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  42.14 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  38.46 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  33.79 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  38.6 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  30.63 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  36 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  39.04 
 
 		 262 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  36.93 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  38.1 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  37.14 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  32.07 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  28.14 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  28.86 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  26.64 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  26.71 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  31.06 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  31.96 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  25.42 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  25.85 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0104  methylmalonyl-CoA epimerase  37.5 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  31.43 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  33.06 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  30.46 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  30.32 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  28.49 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  28.74 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.1 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  26.52 
 
 		 134 aa  46.6  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  27.33 
 
 		 135 aa  46.6  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  30.85 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0032  hypothetical protein  26.85 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1790  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.29 
 
 		 158 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  28.12 
 
 		 129 aa  43.5  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1807  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  32.76 
 
 		 363 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  30.56 
 
 		 137 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4087  hypothetical protein  24.77 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 145 aa  43.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 140 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0680  methylmalonyl-CoA epimerase  29.69 
 
 		 131 aa  42  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227621  normal  0.151437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>