26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1805 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  37.8 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  45.05 
 
 
286 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  50 
 
 
270 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  40.68 
 
 
287 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  40.35 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  32.55 
 
 
302 aa  108  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  37.7 
 
 
282 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  41.36 
 
 
281 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  36.06 
 
 
286 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  39.04 
 
 
285 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  38.5 
 
 
285 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  36.84 
 
 
285 aa  95.5  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  26.94 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  32.77 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  30.48 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  29.63 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  24.28 
 
 
290 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  24.54 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  26.63 
 
 
298 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  29.15 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  26.92 
 
 
297 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  24.61 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  28.22 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  27.07 
 
 
298 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  28.5 
 
 
266 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>