33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0283 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  614  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  37.55 
 
 
282 aa  168  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  35.37 
 
 
286 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  44.63 
 
 
281 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  46.33 
 
 
285 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  40.61 
 
 
285 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  33.79 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  33.84 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  32.98 
 
 
278 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  31.67 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  35.05 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  32.55 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  40.96 
 
 
270 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  28.42 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  30.43 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  32.84 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  26.8 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  26.53 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  28.24 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  29.83 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  24.58 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4087  hypothetical protein  23.94 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  32.18 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  33.14 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  32.3 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  26.98 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2661  hypothetical protein  32.58 
 
 
261 aa  63.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  25.74 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  31.79 
 
 
240 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  27.98 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2048  hypothetical protein  29.46 
 
 
267 aa  45.8  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.128693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>