44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1147 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  90.18 
 
 		 285 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  65.72 
 
 		 285 aa  358  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  39.58 
 
 		 286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  36.71 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  46.33 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  36.81 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  31.82 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  34.22 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  38.5 
 
 		 262 aa  95.9  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  37.57 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  34.66 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  38.86 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  27.12 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  29.07 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  28.5 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  27.4 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  31.4 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  29.83 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  25.34 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  25.42 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  28.87 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  26.01 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  30.66 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0104  methylmalonyl-CoA epimerase  35.58 
 
 		 137 aa  52.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4087  hypothetical protein  25.53 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  30.56 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.32 
 
 		 289 aa  49.3  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  27.27 
 
 		 134 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1790  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  30.85 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  30.39 
 
 		 129 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  29.26 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  28.98 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  34 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2661  hypothetical protein  26.52 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1564  methylmalonyl-CoA epimerase  28.71 
 
 		 134 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.395959 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0680  methylmalonyl-CoA epimerase  32.56 
 
 		 131 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227621  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  27.33 
 
 		 135 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  27.43 
 
 		 137 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  30.09 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  34.38 
 
 		 135 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.71 
 
 		 134 aa  42.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00502246  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3993  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.69 
 
 		 159 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>