32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2890 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  69.75 
 
 		 282 aa  394  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  38.46 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  44.63 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  36.71 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  39.27 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  37.85 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  28.83 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  35.18 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  40.23 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  32.14 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  41.36 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  38.55 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  28.72 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  26.94 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  26.47 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  27.36 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  25.93 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  29.27 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  30.51 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  31.45 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  30.56 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  30.72 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  29.44 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  27.24 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  27.95 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  29.7 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  28.88 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4087  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  27.24 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  26.32 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>