32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2976 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  46.49 
 
 		 287 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  41.82 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  45.05 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  39.27 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  47.31 
 
 		 270 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  33.84 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  37.85 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  32.62 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  37.04 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  36 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  33.78 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  34.22 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  28.18 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  27.62 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  32.42 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  26.22 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  26.57 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  25.26 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  24.63 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  29.72 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  25.17 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  29.1 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  28.37 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  26.38 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  26.81 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  27.6 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  27.46 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  25.81 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2048  hypothetical protein  21.65 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.128693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1845  hypothetical protein  22.04 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0222283  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  27.6 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>