32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2821 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  86.51 
 
 		 289 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  71.97 
 
 		 297 aa  400  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  68.53 
 
 		 291 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  46.83 
 
 		 290 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  30.53 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  31.47 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  29.12 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  32.79 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  30.48 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  28.97 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  31.96 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  32.31 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  27.3 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  31.4 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  23.91 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  28.52 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  27.24 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  28.57 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  25.81 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  28.02 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  30.18 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3013  hypothetical protein  31.46 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  27.47 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  34.44 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  32.14 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2722  hypothetical protein  30.73 
 
 		 230 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.904105  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  38.03 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2661  hypothetical protein  40 
 
 		 261 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>