14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2722 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2722  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  455  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.904105  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3013  hypothetical protein  87.39 
 
 
230 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0595  hypothetical protein  31.58 
 
 
214 aa  88.2  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22130  hypothetical protein  25.98 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0137197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  31.91 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  33.16 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  33.81 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  32.99 
 
 
274 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  34.27 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  28.9 
 
 
260 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  29.65 
 
 
266 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0417  hypothetical protein  23.81 
 
 
311 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  28.72 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2661  hypothetical protein  26.98 
 
 
261 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>