17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2661 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2661  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  28.09 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  29 
 
 
274 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  28.2 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  29.15 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  27.61 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0417  hypothetical protein  26.64 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  27.41 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  32.58 
 
 
302 aa  63.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3013  hypothetical protein  26.37 
 
 
230 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  23 
 
 
286 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1151  hypothetical protein  24.87 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  26.52 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  38.24 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  39.71 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2722  hypothetical protein  26.98 
 
 
230 aa  42.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.904105  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  27.42 
 
 
285 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>