66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2920 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  51.15 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  49.81 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  47.67 
 
 		 244 aa  204  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  47.67 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  48.33 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  33.07 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0417  hypothetical protein  35.85 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2661  hypothetical protein  28.09 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  32.43 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  36.41 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  32.84 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3101  hypothetical protein  26.15 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3082  hypothetical protein  26.34 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2832  hypothetical protein  26.34 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2180  hypothetical protein  26.77 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89503  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2860  hypothetical protein  26.34 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3073  hypothetical protein  26.34 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.586604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  39.29 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3068  hypothetical protein  26.82 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3098  hypothetical protein  26.98 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2853  hypothetical protein  25.38 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2792  hypothetical protein  25.95 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1151  hypothetical protein  32.49 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00378  conserved hypothetical protein  30.81 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.138216  normal  0.0706164 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2048  hypothetical protein  24.81 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.128693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0283  hypothetical protein  29.19 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.162639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  28.19 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2722  hypothetical protein  28.9 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.904105  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0595  hypothetical protein  26.51 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  29.1 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  26.79 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  29.02 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  30.27 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  28.88 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  30.46 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  30.48 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  32.64 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  30.88 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3013  hypothetical protein  28.33 
 
 		 230 aa  48.9  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  28.03 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  25.97 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22130  hypothetical protein  26.7 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0137197 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  37.11 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  36.99 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3104  methylmalonyl-CoA epimerase  38.75 
 
 		 163 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698993  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  36.73 
 
 		 204 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  29.44 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1796  methylmalonyl-CoA epimerase  36.36 
 
 		 170 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  48 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  29.35 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0032  hypothetical protein  26.02 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  33.56 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  35.14 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  28.98 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  31.96 
 
 		 131 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  33.71 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  36.17 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  32.32 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  46 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  39.24 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  34.26 
 
 		 143 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.31 
 
 		 157 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  27.63 
 
 		 238 aa  42  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  33 
 
 		 137 aa  42  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>