47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3387 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  408  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  49.75 
 
 
212 aa  175  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2439  hypothetical protein  50.5 
 
 
200 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872565  hitchhiker  0.00642281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  49.5 
 
 
200 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0735  hypothetical protein  49.25 
 
 
204 aa  156  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  39.11 
 
 
239 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  45.24 
 
 
206 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  37.19 
 
 
215 aa  135  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  37.56 
 
 
216 aa  132  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  39.71 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  34.93 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  35.05 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  34.47 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  39.27 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  35.78 
 
 
225 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  37.85 
 
 
212 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  31.88 
 
 
222 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  37.17 
 
 
230 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  36.65 
 
 
230 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  35.64 
 
 
227 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  36.13 
 
 
230 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1214  hypothetical protein  35.05 
 
 
233 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.835454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  33.48 
 
 
238 aa  95.5  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  36 
 
 
231 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  36.79 
 
 
231 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  36.79 
 
 
256 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  36.13 
 
 
230 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  36.77 
 
 
250 aa  94  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  36 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  32.37 
 
 
212 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  33.18 
 
 
289 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  35.08 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  36.56 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  31.82 
 
 
264 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  31.82 
 
 
227 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  31.82 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  31.82 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  31.82 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  31.82 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1156  hypothetical protein  30.45 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2751  hypothetical protein  27.59 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  33.82 
 
 
274 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  28.66 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  37.14 
 
 
240 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  41.43 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  36.73 
 
 
260 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  28.05 
 
 
266 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>