52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0523 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  481  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  80 
 
 
240 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  50.19 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  54.01 
 
 
249 aa  215  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  51.95 
 
 
263 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  47.67 
 
 
260 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0417  hypothetical protein  33.86 
 
 
311 aa  123  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  33.95 
 
 
266 aa  92.8  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2661  hypothetical protein  28.2 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2048  hypothetical protein  30.61 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.128693  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00378  conserved hypothetical protein  30.33 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.138216  normal  0.0706164 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2832  hypothetical protein  29.53 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3082  hypothetical protein  29.53 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2180  hypothetical protein  29.05 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89503  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3068  hypothetical protein  28.5 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3101  hypothetical protein  30.41 
 
 
265 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3098  hypothetical protein  30 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3073  hypothetical protein  29.02 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.586604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2860  hypothetical protein  29.02 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193154  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2722  hypothetical protein  33.16 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.904105  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2792  hypothetical protein  29.02 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2853  hypothetical protein  27.65 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0283  hypothetical protein  28.49 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.162639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  29.8 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  38.3 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  30.59 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  30.35 
 
 
285 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3013  hypothetical protein  31.63 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  31.08 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  29.44 
 
 
281 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  29.72 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1151  hypothetical protein  27.84 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0032  hypothetical protein  26.48 
 
 
258 aa  55.5  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724697  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2427  hypothetical protein  28.24 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  35.48 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  28.81 
 
 
282 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  30.32 
 
 
285 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.43 
 
 
289 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  30.77 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  41.43 
 
 
204 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  27.23 
 
 
285 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  31.25 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  30.88 
 
 
297 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  29.15 
 
 
262 aa  45.4  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  36.22 
 
 
297 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  42.11 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  35.03 
 
 
212 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  30.43 
 
 
298 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  39.29 
 
 
287 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  43.1 
 
 
215 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  28.26 
 
 
250 aa  42  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>