27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05620 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  53.4 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  39.46 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  31.39 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  31.12 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  34.15 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0032  hypothetical protein  26.74 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  31.25 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  41.18 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  32 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  26.39 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  33.99 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  29.8 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  33.11 
 
 		 274 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  36.67 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  28.03 
 
 		 260 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  25.45 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1845  hypothetical protein  24.84 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0222283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  30.19 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  31.25 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34085  predicted protein  25.16 
 
 		 512 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3278  hypothetical protein  27.95 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  27.85 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  29.86 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  29.73 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  31.29 
 
 		 249 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>