28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0032 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0032  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  530  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2860  hypothetical protein  30.84 
 
 
265 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3073  hypothetical protein  30.84 
 
 
265 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.586604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2832  hypothetical protein  30.84 
 
 
265 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3082  hypothetical protein  30.84 
 
 
265 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3098  hypothetical protein  31.58 
 
 
265 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2853  hypothetical protein  29.96 
 
 
265 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3101  hypothetical protein  29.96 
 
 
265 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2792  hypothetical protein  30.43 
 
 
265 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3068  hypothetical protein  32.66 
 
 
265 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2180  hypothetical protein  30.91 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89503  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2048  hypothetical protein  32.35 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.128693  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2289  hypothetical protein  27.31 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000511946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2331  hypothetical protein  27.31 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00833675  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  30.07 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0283  hypothetical protein  27.98 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.162639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1151  hypothetical protein  32.3 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1845  hypothetical protein  27.69 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0222283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  22.94 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  26.74 
 
 
216 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  26.48 
 
 
244 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  26.71 
 
 
229 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  25.45 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  26.02 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  26.85 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  24.15 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  24.48 
 
 
297 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  28.18 
 
 
216 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>