22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1845 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1845  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0222283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2289  hypothetical protein  50.4 
 
 
254 aa  269  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000511946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2331  hypothetical protein  50.4 
 
 
254 aa  269  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00833675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3082  hypothetical protein  28.22 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2860  hypothetical protein  28.22 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193154  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2832  hypothetical protein  28.22 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3073  hypothetical protein  28.22 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.586604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2792  hypothetical protein  27.47 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2853  hypothetical protein  28.36 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2180  hypothetical protein  26.87 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89503  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1151  hypothetical protein  24.75 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3068  hypothetical protein  27.98 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3101  hypothetical protein  26.92 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2048  hypothetical protein  25.12 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.128693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0032  hypothetical protein  27.69 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3098  hypothetical protein  26.79 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  28.03 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0283  hypothetical protein  28.36 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.162639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  21.76 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  24.84 
 
 
216 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  26.67 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  22.04 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>