45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3617 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  46.34 
 
 
239 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  47.57 
 
 
216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  47.06 
 
 
219 aa  157  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  42.03 
 
 
212 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  42.08 
 
 
212 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  41.71 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  40.72 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  38.83 
 
 
212 aa  138  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  37.19 
 
 
204 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  40.72 
 
 
225 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0735  hypothetical protein  43.22 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  37.02 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  40.29 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  37.21 
 
 
246 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  38.57 
 
 
227 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1214  hypothetical protein  37.12 
 
 
233 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.835454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  33.65 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  35.87 
 
 
230 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  35.87 
 
 
230 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  36.65 
 
 
289 aa  115  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  35.43 
 
 
230 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  36.61 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  36.61 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  41.29 
 
 
200 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1156  hypothetical protein  37.79 
 
 
227 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  37.05 
 
 
231 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  36.82 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  36.82 
 
 
264 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  36.82 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  36.82 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2439  hypothetical protein  40.8 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872565  hitchhiker  0.00642281 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  36.82 
 
 
264 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  35.87 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  36.82 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2751  hypothetical protein  34.64 
 
 
167 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  34.35 
 
 
238 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  37.78 
 
 
245 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  37.56 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  35.78 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  34.39 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  29.23 
 
 
229 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  30.19 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  34.48 
 
 
266 aa  42.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  43.1 
 
 
244 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>