45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2349 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  97.84 
 
 
231 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  90.04 
 
 
230 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  90.48 
 
 
230 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  87.01 
 
 
230 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  83.55 
 
 
230 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  71.43 
 
 
289 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  66.67 
 
 
227 aa  310  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1214  hypothetical protein  65.11 
 
 
233 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.835454 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  72.29 
 
 
264 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  72.29 
 
 
227 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  72.29 
 
 
227 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  72.29 
 
 
227 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  71.86 
 
 
264 aa  294  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  71.86 
 
 
227 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1156  hypothetical protein  71 
 
 
227 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  57.58 
 
 
225 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  57.58 
 
 
225 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  42.73 
 
 
216 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  42.55 
 
 
230 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  42.41 
 
 
219 aa  126  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  38.59 
 
 
238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  39.08 
 
 
245 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  36.89 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  36.61 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  38.33 
 
 
212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  40 
 
 
212 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  42.67 
 
 
206 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  37.93 
 
 
250 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  34.36 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  38.27 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0735  hypothetical protein  39.64 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  35.03 
 
 
220 aa  95.9  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  36.79 
 
 
204 aa  95.1  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  40.38 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2751  hypothetical protein  45.56 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2439  hypothetical protein  37.99 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872565  hitchhiker  0.00642281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  37.61 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  32.59 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  49.25 
 
 
263 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34085  predicted protein  23.31 
 
 
512 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  47.83 
 
 
274 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06030  hypothetical protein  43.1 
 
 
216 aa  42.4  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>