30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2743 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  47.83 
 
 		 216 aa  185  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  44.08 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  39.29 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  32.34 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  37.93 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  38.3 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  30.45 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  38.1 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  27.84 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  37.65 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  31.38 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34085  predicted protein  26.06 
 
 		 512 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  37.33 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  32.24 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  27.85 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  36.23 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0032  hypothetical protein  26.71 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724697  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  36.54 
 
 		 162 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  28.19 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  33.55 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  30.46 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4303  hypothetical protein  29.26 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0361171  normal  0.12147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.42 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  31.61 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  36 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  42.62 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  29.94 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  34.48 
 
 		 249 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1359  hypothetical protein  26.34 
 
 		 212 aa  42  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000393544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>