58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0218 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  471  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  80 
 
 		 244 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3520  hypothetical protein  54.81 
 
 		 249 aa  222  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.347044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  48.67 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  50.58 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  47.67 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0417  hypothetical protein  32.55 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  32.66 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3101  hypothetical protein  28.52 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3068  hypothetical protein  28.35 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2180  hypothetical protein  27.91 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2048  hypothetical protein  28.93 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.128693  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2661  hypothetical protein  27.61 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3082  hypothetical protein  27.89 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2832  hypothetical protein  27.89 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2722  hypothetical protein  31.91 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.904105  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2860  hypothetical protein  27.89 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3073  hypothetical protein  27.89 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.586604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2853  hypothetical protein  26.77 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2792  hypothetical protein  27.49 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00378  conserved hypothetical protein  29 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.138216  normal  0.0706164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  32.42 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  30.97 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3013  hypothetical protein  31.63 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3098  hypothetical protein  26.29 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  27.66 
 
 		 286 aa  62  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  36.36 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  31.79 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0283  hypothetical protein  24.39 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.162639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1151  hypothetical protein  27.43 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  38.1 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  31.63 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  29.23 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  29.7 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  28.49 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  25.77 
 
 		 287 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0032  hypothetical protein  25.45 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724697  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  31.94 
 
 		 300 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  29.63 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  37.14 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  29.78 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  30.85 
 
 		 290 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  48.21 
 
 		 200 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2427  hypothetical protein  26.98 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  30.47 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  30.84 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  29.47 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  34.56 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  30.72 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  30.09 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  29.86 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  32.61 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3653  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.31 
 
 		 302 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  42.86 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  38.6 
 
 		 206 aa  42.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  32.85 
 
 		 297 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  30.67 
 
 		 225 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>