37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3224 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  71.28 
 
 		 289 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  71.97 
 
 		 289 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  65.73 
 
 		 291 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  43.9 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  30.42 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  28.72 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  28.28 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  28.01 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  25.45 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  28.52 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  33.14 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  29.15 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  30 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  31.34 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  26.6 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  26.57 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  29.11 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  26.28 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  27.12 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  29.73 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  26.01 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  30.34 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  31.75 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4087  hypothetical protein  30.82 
 
 		 338 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  28.74 
 
 		 240 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2722  hypothetical protein  29.78 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.904105  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2048  hypothetical protein  26.35 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.128693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3068  hypothetical protein  26.97 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3082  hypothetical protein  29.05 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2832  hypothetical protein  29.05 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2792  hypothetical protein  26.71 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3098  hypothetical protein  30.2 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0032  hypothetical protein  24.48 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2860  hypothetical protein  29.05 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3073  hypothetical protein  29.05 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.586604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2180  hypothetical protein  28.86 
 
 		 265 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>